Historia e viruseve daton në gjysmën e dytë të shekullit të 20-të. Sidoqoftë, të dhëna më të sakta ndryshojnë: disa argumentojnë se viruset e para u shfaqën në vitet 1960, të tjerët argumentojnë se ishte 1981. Çështja është se çfarë saktësisht mund të konsiderohet virus.
Pseudo-viruset e para
Fjala kyçe në përcaktimin e një virusi është "e dëmshme". Të njëjtat programe, të cilat quhen viruse të para, nuk i shkaktuan dëm kompjuterit. Ishte, për shembull, loja kompjuterike "Animal", e cila konsiston në hamendjen e kafshëve dhe ka mbledhur një mori adhuruesish. Autori i lojës ishte lodhur nga kërkesat e pafundme nga përdoruesit për t'i dërguar atyre këtë lojë (dhe në vitin 1974 nuk ishte një detyrë e lehtë - ishte e nevojshme të regjistronte lojën në shirit magnetik dhe ta dërgonte me postë). Prandaj, ai krijoi një nënrutinë "Pervade", e cila në mënyrë të pavarur "udhëtoi" nga kompjuteri në kompjuter dhe regjistroi lojën "Kafshë" në secilën prej tyre. Nuk ka gjasa që të paktën një kompjuter të ketë vuajtur nga kjo "befasi" e thjeshtë.
Creeper, i prezantuar në fillim të viteve 1970, ishte një program demo vetëlëvizës: kur një kopje e re e Creeper do të nisej në një kompjuter të ri, ai i mëparshmi do të ndalonte së punuari. Dhe puna e saj ishte vetëm të shfaqte mesazhin "Unë jam Creeper … më kap nëse mundesh". Më vonë, u shkrua programi Reaper, i cili gjithashtu kaloi nga kompjuteri në kompjuter dhe "gjuante" për Creeper, duke e bllokuar atë.
Pak më i bezdisshëm dhe i ngjashëm me një virus të vërtetë ishte përbindëshi i Biskotave. Ky program shfaq terminën "Më jep cookies" në terminal dhe e bllokoi atë derisa operatori të fuste fjalën "cookie".
Viruse të vërtetë pionierë
Një nga viruset e para të vërteta konsiderohet të jetë shkruar nga një shkollë 15-vjeçare Elk Cloner për kompjuterat personal Apple II. Ai gjithashtu nuk ndikoi në funksionimin e kompjuterit, por tashmë mund të dëmtojë padashur disqet që përmbajnë një imazh jo standard të DOS, të mbishkruajnë pjesët rezervë, pavarësisht nga përmbajtja e tyre. Pas çdo nisjeje të 50-të, virusi shfaqi një rimë duke thënë se Elk Cloner është një program me personalitet që "do të futet në të gjitha disqet tuaja, do të futet në të gjitha patate të skuqura, do t'ju ngjitet si ngjitës dhe do të ndryshojë RAM-in tuaj".
Bashkëkohorja e tij, Virusi 1, 2, 3, ishte pothuajse i njëjtë, megjithëse ai u shfaq i pavarur nga Cloner. Të dy viruset u krijuan në 1981.
Së shpejti, filloi epoka e viruseve me të vërtetë të dëmshme, të cilat "maskuan veten" si programe të dobishme dhe shkatërruan të dhënat e përdoruesve. Fred Cohen madje shkroi një artikull mbi viruset e skedarëve - studimi i parë akademik mbi këtë temë. Coshtë Cohen ai që konsiderohet të jetë autori i termit "virus", megjithëse ky term u sugjerua nga këshilltari i tij shkencor.